More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1427 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.8 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.28 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05630  Transcriptional regulatory protein, DeoR family  27.2 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.557684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.94 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  32.94 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003595  transcriptional repressor of aga operon  29.89 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.28 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.3 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0561  lactose transport regulator  29.75 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.324398  hitchhiker  0.00000158466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.29 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.89 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.89 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.89 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  29.84 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.49 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.49 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.89 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.44 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.49 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.4 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.4 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  28.17 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  31.17 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.83 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  28.98 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>