More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05630  Transcriptional regulatory protein, DeoR family  100 
 
 		 259 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.557684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003595  transcriptional repressor of aga operon  36.73 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  26.41 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  22.05 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.97 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  28.28 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  24.78 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  26.46 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  26.75 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  29.69 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.14 
 
 		 269 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  28.21 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  22.22 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  24.5 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  25.65 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 376 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.06 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  25.4 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  25.59 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.41 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  22.65 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  27.97 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.49 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.39 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.49 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  30.22 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  25.2 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0669  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000886161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  29.18 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1288  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  29.05 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>