More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2796 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  69.14 
 
 
256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  69.14 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0219  DeoR family transcriptional regulator  65.5 
 
 
257 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800116  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  48.06 
 
 
258 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  50.39 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  47.86 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  47.08 
 
 
256 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
260 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
256 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
256 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 
250 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.46 
 
 
258 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.93 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
252 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.62 
 
 
278 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
255 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  41.42 
 
 
256 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.05 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.05 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.05 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.05 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.94 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.05 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  36.02 
 
 
247 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 
266 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 
257 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.51 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.51 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.61 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
254 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  40.27 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
252 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
251 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.68 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.38 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.9 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.9 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.9 
 
 
252 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  31.38 
 
 
263 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.49 
 
 
252 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
253 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
254 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  36.67 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.33 
 
 
255 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
251 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.91 
 
 
252 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.96 
 
 
263 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
253 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
256 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
269 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
257 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.78 
 
 
252 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
251 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
256 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
250 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
348 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.33 
 
 
253 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.33 
 
 
257 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
250 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  29.54 
 
 
256 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  35.74 
 
 
250 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
268 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 
253 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
253 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 
289 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
256 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
266 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
251 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 
263 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
275 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  30.93 
 
 
249 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
252 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.36 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.36 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
270 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 
261 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>