More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0326 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  53.04 
 
 
248 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  42.22 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  41.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
249 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  41.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  41.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
248 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
253 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  40.91 
 
 
246 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  40.85 
 
 
246 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  33.18 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
254 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.2 
 
 
250 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 
253 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
267 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
258 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 
260 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.87 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.51 
 
 
257 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
253 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.58 
 
 
254 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
252 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
253 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.63 
 
 
251 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
254 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.63 
 
 
251 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.78 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  26.75 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.78 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  26.75 
 
 
278 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35.19 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  34.76 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  34.76 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  34.76 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  34.76 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 
257 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 
256 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.3 
 
 
269 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
257 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
256 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.44 
 
 
258 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 
254 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
251 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  30.34 
 
 
263 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.3 
 
 
257 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
252 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 
258 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  28.05 
 
 
253 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 
255 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
250 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  29.5 
 
 
276 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 
256 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
266 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
251 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.87 
 
 
263 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
254 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
252 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2267  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 
259 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.481568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 
267 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
254 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
251 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.15 
 
 
254 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  32.19 
 
 
259 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.19 
 
 
259 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.19 
 
 
257 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.19 
 
 
257 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>