More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1515 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  99.6 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  99.6 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  99.6 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  99.2 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  99.2 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  82.59 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  82.59 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  78.63 
 
 		 253 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 248 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  54.25 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  52.46 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  40.16 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.34 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.68 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  31.08 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 290 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.33 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  30.34 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  34.97 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.58 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  29.32 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  28.8 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  28.8 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.72 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>