More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4038 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.82 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.82 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  38.55 
 
 
252 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  40.17 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
256 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  42.61 
 
 
257 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
273 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  39.32 
 
 
252 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  39.32 
 
 
252 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
251 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
251 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  39.32 
 
 
252 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
286 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
251 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.55 
 
 
252 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
252 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  39.32 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
253 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
268 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  37.96 
 
 
251 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.95 
 
 
252 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.89 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  37.7 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  36.25 
 
 
252 aa  165  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
265 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.14 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  33.06 
 
 
263 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.55 
 
 
252 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.14 
 
 
252 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.14 
 
 
252 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
253 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  34.89 
 
 
263 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.84 
 
 
270 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  33.87 
 
 
255 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
256 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  37.75 
 
 
263 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.75 
 
 
314 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
256 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
277 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
266 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
259 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  39.82 
 
 
256 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
284 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  40.79 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
259 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
254 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  39.3 
 
 
267 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.02 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.02 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
274 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.02 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.02 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.02 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
257 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
261 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  37.95 
 
 
254 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
278 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
278 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
259 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
259 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
259 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
259 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.1 
 
 
259 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.69 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.37 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  35.37 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  35.92 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
294 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  35.37 
 
 
269 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
259 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
290 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
262 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
255 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  35.25 
 
 
262 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
294 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
259 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
262 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  38.79 
 
 
257 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
294 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>