More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1563 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  99.6 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  97.2 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  46.8 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  47.58 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  47.18 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  44.58 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4008  transcriptional regulator, DeoR family  45.97 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.87 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  34.05 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.74 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.74 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  32.1 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.28 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.75 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.75 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.75 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.75 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.2 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  35.02 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.86 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.35 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.35 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.73 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.95 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  38.36 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  35.44 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.1 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  33.33 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  30.36 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  35.12 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  34 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>