More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0130 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.96 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 236 aa  112  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.16 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  32.38 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  30.8 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  28.51 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  27.62 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.74 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  31.6 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  32.17 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.78 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.78 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.78 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.62 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  29.54 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 258 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.86 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 254 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.21 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.21 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.06 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.73 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.21 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>