More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0778 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  89.33 
 
 
274 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  49.8 
 
 
274 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  49.02 
 
 
260 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  46.25 
 
 
252 aa  228  8e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 
268 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  45.2 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  45.2 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 
254 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
269 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
263 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  44.92 
 
 
255 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
255 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
263 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
255 aa  215  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
255 aa  215  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
254 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.53 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  44.53 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  44.53 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  46 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
256 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
256 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
256 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  44.76 
 
 
253 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  42.4 
 
 
251 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
252 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3732  transcriptional regulator, DeoR family  47.28 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  44.13 
 
 
221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
276 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 
269 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  36.96 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  36.96 
 
 
255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 
269 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
257 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
254 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
274 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
264 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  28.91 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  35.88 
 
 
263 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.29 
 
 
269 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 
282 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.4 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
257 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
257 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
250 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
259 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
257 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
257 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
259 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 
267 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.72 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 
290 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 
266 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
257 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
289 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  34.06 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  31.9 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
258 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 
255 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
261 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
260 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>