More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6947 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  95.31 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  59.61 
 
 		 254 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  46.67 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.91 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.91 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.91 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.53 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.96 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.76 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.76 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.76 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.76 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.76 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.92 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.96 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.07 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.07 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.23 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  40.74 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.3 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  35.56 
 
 		 240 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  38.37 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  37.6 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  37.6 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  37.6 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  37.6 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  37.89 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  34.22 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  30.56 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  27.67 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  29.92 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  26.64 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  29.13 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  29.27 
 
 		 281 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.41 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  28.52 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  23.92 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  23.92 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  25.68 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  25 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  26.19 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  25 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  31.38 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  28.02 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  27.31 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  26.36 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  27.34 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  24.81 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>