More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4660 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  87.08 
 
 		 241 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  88.98 
 
 		 241 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  88.51 
 
 		 241 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  45.26 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  45.11 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  37.66 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.81 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.3 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.96 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.96 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.96 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.95 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.17 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.95 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.95 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.95 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.52 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  37.99 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.1 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.66 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.26 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  32.62 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  32.62 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  32.62 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  32.62 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  32.62 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.5 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.99 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  30.6 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  28.94 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  29.41 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  27.9 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.49 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 263 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  30.51 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  27.54 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.15 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  26.92 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  30.41 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.91 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  28.51 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  24.58 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.91 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  26.18 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>