More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2304 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  52.19 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  46.43 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 254 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  44.02 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.75 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.29 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  38.71 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.26 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.59 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.58 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.74 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.88 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.45 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.45 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.8 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.45 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  37.13 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  35.8 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  35.8 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  35.8 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  35.8 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  35.8 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  30.5 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.06 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  30 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  29.62 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  29.23 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  29.23 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  29.23 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  27.2 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.38 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.03 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.03 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.74 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  31.5 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.04 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  26.04 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  26.18 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  26.04 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.13 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.56 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  26.51 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  29.18 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.27 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  28.27 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  30.34 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  28.27 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>