More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1406 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  96.68 
 
 		 241 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  92.95 
 
 		 241 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  87.08 
 
 		 240 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  45.85 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.1 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  38.96 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.3 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.3 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.3 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  40.44 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.3 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.05 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.87 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.87 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.87 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.87 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.43 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.42 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.13 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.86 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  38.86 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.43 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.55 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  36.68 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  32.9 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  32.9 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  32.9 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  32.9 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  32.9 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  32.07 
 
 		 258 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  28.93 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  29.83 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  25.85 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.81 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  27.31 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  27.31 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  26.5 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  27.31 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  27.31 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  27.31 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  32.88 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  29.86 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.22 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  29.24 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  29.41 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  27.76 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  27.35 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  28.1 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.97 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.97 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.88 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  26.32 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>