More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0832 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  42.37 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  44.54 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  43.3 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 235 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  33.62 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  33.62 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  33.62 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  36.63 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  36.17 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.95 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.32 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.89 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.89 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  34.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  36.29 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.44 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.04 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  31.62 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  33.06 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  33.62 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  27.12 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  28.27 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  28.27 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  28.27 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  28.27 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  28.27 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.64 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  27.9 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  28.4 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  26.02 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  27.39 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  30.09 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  26.02 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  27.43 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  29.76 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  26.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  26.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  26.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  27.51 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>