More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0747 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  48.96 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  48.96 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  48.96 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  46.5 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  46.5 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  47.03 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.81 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.67 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.02 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.16 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  41.91 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.95 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.95 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.95 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.95 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.53 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  37.04 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  37.04 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  37.04 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  37.04 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  37.04 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  37.12 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  32.43 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  30.36 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.6 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  27.5 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  28.57 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  28.87 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  28.64 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  27.48 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  30.14 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  25.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  25.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  25.65 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  27.59 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  26.61 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  25.51 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  27.06 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  25.54 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  25.73 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  27.06 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  25.12 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  24.89 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  27.35 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  27.35 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  25.75 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  27.35 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  26.69 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  27.35 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  27.35 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.29 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  26.27 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>