More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1724 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  99.62 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  99.62 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  99.25 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  89.8 
 
 		 260 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  89.8 
 
 		 260 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  89.8 
 
 		 260 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.24 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.05 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.69 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  27.52 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  27.89 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  27.86 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  27.67 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  27.67 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  28.81 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  27.84 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.8 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.8 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  27.62 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.46 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  27.34 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  27.34 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  27.34 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.96 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  25.1 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.95 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  30.1 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.24 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.34 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  26.54 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  28.28 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>