More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6903 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  95.31 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  94.92 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  94.92 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  60.78 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  46.67 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.52 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.52 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.52 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.75 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.57 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.35 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  41.56 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  44.92 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.57 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.18 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.23 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.22 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  43.22 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.69 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  35.56 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  38.22 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  38.22 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  38.37 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  38.37 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  37.6 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  29.76 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  30.08 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  30.08 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  30.08 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  30.08 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  30.08 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  29.3 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  25.87 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  29.3 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  28.19 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  29.27 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.4 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  25 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  25 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  26.72 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  27.42 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 290 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  25.79 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  28.02 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  22.75 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  22.75 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  25.69 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  28.35 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  25.98 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.98 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>