More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3356 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  89.26 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  40.45 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  34.38 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.68 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.14 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.68 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.68 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.68 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.68 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.93 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.77 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.77 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.77 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  32.43 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  32.75 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  33.88 
 
 		 280 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  31.88 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.23 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  34.5 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.13 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  26.47 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  28.7 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  28.7 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  28.88 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  28.26 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  28.26 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.03 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  28.63 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.75 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  32.75 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.57 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.69 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.82 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  26.34 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  29.95 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  31.31 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.34 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  31.31 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  32.24 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.73 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>