More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7829 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  49.33 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  44 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.35 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.42 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.73 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.04 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.05 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.04 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.04 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.04 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  39.92 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  35 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.44 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.44 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.44 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.44 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  35.22 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  31.33 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  31.33 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  30.92 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  30.92 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  30.92 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  28.1 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.4 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  26.72 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  24.8 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  26.34 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.69 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  26.48 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  26.4 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  26.21 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  29.15 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  26.72 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1041  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  29.05 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  25.83 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  28.98 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  24.29 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.5 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  27.41 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  25.2 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  27.13 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  24.9 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  27.03 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  27.03 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  28.68 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  25.1 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.1 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>