More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D07 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  55.69 
 
 
258 aa  278  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  43.25 
 
 
249 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  38.04 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  45.34 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  45.34 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  45.15 
 
 
251 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  34.8 
 
 
252 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 
247 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 
248 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  34.84 
 
 
252 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
254 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 
267 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 
256 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.47 
 
 
263 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
264 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
274 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  35.4 
 
 
247 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  37.13 
 
 
233 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
250 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
260 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  35.44 
 
 
248 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 
262 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
248 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  30.99 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
250 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
269 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
269 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1851  regulatory protein, DeoR  32.8 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
253 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  31.54 
 
 
255 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  31.54 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
259 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  33.75 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 
250 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
268 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
258 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.93 
 
 
257 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.93 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.93 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.93 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
252 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  31.45 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.93 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.05 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  33.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
263 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
263 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.53 
 
 
252 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
264 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
294 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 
257 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.71 
 
 
255 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.27 
 
 
257 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.89 
 
 
257 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
289 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.54 
 
 
252 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 
250 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>