More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0039 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  44.94 
 
 
248 aa  208  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  42.34 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
252 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  37.6 
 
 
255 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  36.65 
 
 
258 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 
250 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  33.74 
 
 
254 aa  159  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 
249 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
256 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  36.21 
 
 
251 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  36.21 
 
 
247 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  32.64 
 
 
263 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
263 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  36.7 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.98 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 
253 aa  125  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
288 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.44 
 
 
263 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
257 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.83 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
253 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  30.2 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  31.12 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 
250 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
261 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  30.61 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  28.31 
 
 
253 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  28.09 
 
 
254 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31 
 
 
252 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
250 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
273 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 
256 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  28.89 
 
 
262 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
256 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  27.76 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  31.3 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  32.91 
 
 
256 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
256 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  27.76 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.47 
 
 
252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.47 
 
 
252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.47 
 
 
252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 
264 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.47 
 
 
252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.47 
 
 
252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  29.72 
 
 
257 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  29.72 
 
 
257 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  29.72 
 
 
257 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 
254 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 
267 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
253 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
254 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
252 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  29.72 
 
 
257 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  29.72 
 
 
257 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
259 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  31.44 
 
 
251 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
257 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.69 
 
 
252 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4983  transcriptional regulator, DeoR family  29.27 
 
 
289 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947934  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
257 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
258 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
257 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>