More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0922 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  63.6 
 
 		 269 aa  338  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  62.25 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  62 
 
 		 276 aa  328  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  60.4 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  41.74 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.14 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  38.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  38.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  37.14 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  37.83 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  41.63 
 
 		 221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  37.66 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  34.65 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.67 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  35.74 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.28 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  34.4 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.67 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.12 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.49 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  31.09 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.66 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  31.09 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.45 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  32.77 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  32.38 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.85 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.85 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  34.85 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.85 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.85 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>