More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1851 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1851  regulatory protein, DeoR  100 
 
 
264 aa  507  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2786  transcriptional regulator, DeoR family  60.15 
 
 
268 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.43 
 
 
263 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 
258 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  38.93 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 
257 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  32.8 
 
 
255 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 
254 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.06 
 
 
250 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
256 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 
256 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  29.44 
 
 
254 aa  121  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
253 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  33.76 
 
 
257 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.76 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.76 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.77 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.76 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.11 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.76 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
260 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
267 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.4 
 
 
258 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
257 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
263 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  32.43 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30.98 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30.98 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.16 
 
 
266 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
257 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
256 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 
260 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  36.03 
 
 
257 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4943  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
254 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
268 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  39.91 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  38.53 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.54 
 
 
269 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2798  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
256 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0120141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
256 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 
256 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
260 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
256 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2498  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
256 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
253 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 
258 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  27.91 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  31.69 
 
 
253 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
258 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.32 
 
 
269 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
254 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
254 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  37.84 
 
 
263 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
253 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
251 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 
254 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>