More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2279 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  45.45 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  40.85 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  42.8 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  38.24 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  41.25 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.32 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.32 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  39.32 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  38.24 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  40.45 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.39 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  37.24 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.71 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.71 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.71 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.71 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  35.29 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  34.18 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  32.77 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  32.77 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  32.77 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  32.77 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  33.88 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  28.99 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  31.43 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04165  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3700  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04127  hypothetical protein  28.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  29.73 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  28.94 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  30.34 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1796  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1735  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1543  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1724  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  normal  0.195936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1732  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  31.92 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  27.04 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  25.83 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  26.89 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  31.46 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  27 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.23 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28.44 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.56 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.47 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  27.78 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.23 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.23 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.23 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.23 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  29.28 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  25.94 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  27.18 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  25.11 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  26.81 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  26.81 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.81 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.81 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>