More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2653 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2738  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1555  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2653  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1631  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  74.21 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1684  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  65.08 
 
 		 257 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2394  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  66.01 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1950  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  64.68 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2294  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  64.03 
 
 		 259 aa  334  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1331  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  57.54 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0900  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  59.84 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0936  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  59.84 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1016  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  59.84 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135969  normal  0.413483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0997  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  59.84 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0968  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  59.43 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0911  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  56.75 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2505  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  57.14 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00807  DNA-binding transcriptional repressor  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2802  transcriptional regulator, DeoR family  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0901  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.356535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00824  hypothetical protein  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2802  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.966076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0993  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  56.75 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.743994  normal  0.246087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0867  DNA-binding transcriptional repressor DeoR  56.35 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0747  deoxyribose operon repressor  48.96 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000421917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  48.09 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4004  deoxyribose operon repressor  43.31 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4075  deoxyribose operon repressor  43.31 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4125  deoxyribose operon repressor  43.31 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4183  deoxyribose operon repressor  43.31 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4020  deoxyribose operon repressor  43.31 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2304  DeoR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2279  transcriptional regulator, DeoR family  39.32 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1406  DeoR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5189  transcriptional regulator, DeoR family  39.3 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7829  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4660  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.859763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1267  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 241 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792859  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0832  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.707572  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3464  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3731  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2844  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3356  hypothetical protein  32.77 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  29.61 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  26.74 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  27.23 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  29.2 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  25.98 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.26 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.98 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.98 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.98 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.98 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  26.69 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.69 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  27.16 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.69 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  24.7 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.18 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.4 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.4 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.4 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.4 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  24.8 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  25.6 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  26.95 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>