More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0977 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  99.61 
 
 
265 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  99.61 
 
 
255 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  99.61 
 
 
255 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 
255 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  99.61 
 
 
265 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  87.01 
 
 
254 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  87.01 
 
 
254 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  86.61 
 
 
254 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  86.61 
 
 
254 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  85.83 
 
 
254 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  66.4 
 
 
254 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  62.7 
 
 
252 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  61.9 
 
 
253 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  62.7 
 
 
256 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  62.7 
 
 
256 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  62.7 
 
 
256 aa  319  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  47.01 
 
 
252 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  46.4 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
269 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 
274 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
270 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
270 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  49.31 
 
 
221 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  44.92 
 
 
256 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  43.48 
 
 
260 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  43.48 
 
 
274 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  42.06 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 
276 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3732  transcriptional regulator, DeoR family  41.11 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
251 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  36.1 
 
 
269 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
269 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  34.66 
 
 
255 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 
257 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  34.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 
250 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.17 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 
257 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.11 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
282 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  34.85 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
261 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  34.74 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.84 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.43 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
258 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.94 
 
 
258 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.25 
 
 
290 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
264 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 
258 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
248 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
267 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 
256 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.92 
 
 
258 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
258 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.92 
 
 
258 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 
263 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
267 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
289 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 
267 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.64 
 
 
248 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
250 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>