More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0617 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  38.53 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  38.53 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  35.83 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  40.57 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  40.09 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  39.66 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  37.4 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  38.98 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  35.93 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  36.21 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  35.04 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  36.7 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  34.74 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.78 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  30.04 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.63 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  33.33 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  30.18 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  32.87 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.98 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0642  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  29.73 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.48 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  29.38 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.98 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.8 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  26.53 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  32.87 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  30.88 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  29.41 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.98 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  31.14 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>