More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0324 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1287  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  36.96 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  36.96 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.1 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.81 
 
 		 260 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  34.43 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.08 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  30.53 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.85 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  32.08 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.46 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  33.63 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  31.42 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  32.28 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.05 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.74 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1851  regulatory protein, DeoR  31.91 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  31.06 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.4 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.59 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.8 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.95 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  32.8 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.8 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  32.95 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.72 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  31.6 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>