More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0642 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0642  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1287  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.95 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.48 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.66 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.39 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 274 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  28.88 
 
 		 290 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  27.54 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  29.63 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  27.12 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  31.05 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  27.23 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  27.12 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  30.43 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  30.43 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  30.09 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>