More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4431 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 194 aa  370  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 242 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  61.54 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  53.61 
 
 		 252 aa  204  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  50 
 
 		 254 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  47.89 
 
 		 252 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 256 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.48 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 268 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  39.33 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  37.23 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  42.13 
 
 		 264 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 248 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.57 
 
 		 256 aa  98.6  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  36.47 
 
 		 257 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.22 
 
 		 253 aa  97.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 273 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.86 
 
 		 253 aa  97.8  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  36.47 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  36.47 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.28 
 
 		 250 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  36.47 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  36.47 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.53 
 
 		 258 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 257 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 265 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  35.75 
 
 		 262 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 251 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 		 264 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 260 aa  91.3  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30 
 
 		 258 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 258 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 260 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 253 aa  90.5  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30 
 
 		 258 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.67 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 267 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.8 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  33.71 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.35 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  35.23 
 
 		 261 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.35 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 		 255 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.35 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.52 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.52 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.52 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.52 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 274 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.88 
 
 		 257 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.52 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  34.95 
 
 		 252 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.94 
 
 		 257 aa  88.2  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 257 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.94 
 
 		 257 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.94 
 
 		 259 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.94 
 
 		 257 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  29.89 
 
 		 252 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 257 aa  88.2  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  29.89 
 
 		 252 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.89 
 
 		 252 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.76 
 
 		 252 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.6 
 
 		 269 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.89 
 
 		 252 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  32.73 
 
 		 259 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  34.76 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.74 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.74 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  23.56 
 
 		 252 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 253 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.21 
 
 		 258 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.72 
 
 		 257 aa  85.1  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 		 260 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 258 aa  84.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 260 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  31.4 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>