More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1048 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  41.86 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  40.7 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 274 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  40.93 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.52 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  35.2 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.05 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.05 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.05 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.36 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.01 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.36 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.4 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  30.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.94 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  29.96 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  30.35 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.82 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  26.46 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.64 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.89 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  31.89 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.21 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  30.5 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  27.91 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.01 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.72 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  28.02 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  27.91 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  30.86 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  31.52 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.03 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>