More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4661 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  99.6 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  63.04 
 
 		 257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  33.2 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  32.42 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  26.83 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  28.24 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.02 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.46 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.42 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.56 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.86 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.97 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.08 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  26.8 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.17 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  27.76 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  30.09 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.97 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  27.24 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  25.59 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  26.19 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  29.62 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  25.9 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  27.95 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.57 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  27.16 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  26.88 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  27.78 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>