More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2185 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  36.98 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  32.28 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  31.6 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  31.2 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  31.2 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  31.2 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  31.2 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  31.2 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  30.12 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  32.53 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  28.92 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.28 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  27.47 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.11 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.03 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  28.35 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  27.89 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  26.44 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  24.11 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  27.57 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  27.42 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.45 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  27.69 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  27.69 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  27.69 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  27.69 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.44 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  27.31 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  26.21 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  26.15 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  27.09 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.49 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.49 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.09 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.09 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  27.09 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  29.73 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.69 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.49 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  28.25 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  26.92 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>