More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0286 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 257 aa  533  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  80.16 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  63.04 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  56.81 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  33.21 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.02 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  25.79 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.08 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.79 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.14 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  31.72 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28.79 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  27.31 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  27.92 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  26.95 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  26.74 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  25.68 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  26.69 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  25.48 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  25.1 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.42 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28.19 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  23.35 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  25.19 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  27.52 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.29 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  26.24 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  28.79 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  28.83 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  27.52 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  25.87 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  29.1 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  22.61 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  26.05 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  27.55 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  27.61 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.62 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>