More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6709 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
270 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  91.11 
 
 
270 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  80 
 
 
270 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  75.55 
 
 
274 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  68.52 
 
 
270 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
278 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  67.45 
 
 
284 aa  358  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 
262 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  33.46 
 
 
251 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  33.07 
 
 
251 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  31.8 
 
 
257 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  31.76 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  30.86 
 
 
251 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  30.08 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  30.08 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  30.08 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  30.08 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  30.08 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  30.47 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 
257 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 
252 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
258 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28 
 
 
254 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.83 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  30.83 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.46 
 
 
258 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.12 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
285 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.89 
 
 
257 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
264 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
250 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.74 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 
257 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.12 
 
 
257 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  29.76 
 
 
248 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
242 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  27.1 
 
 
252 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  27.95 
 
 
254 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.69 
 
 
269 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 
257 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
256 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  32.19 
 
 
237 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.06 
 
 
254 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
266 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
249 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
251 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
263 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
253 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
268 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
260 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 
263 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
254 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 
250 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>