More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0122 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  520  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  80.16 
 
 		 257 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  69.76 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  59.36 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  33.98 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  35.04 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  25.81 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  26.77 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.98 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  30.27 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  32.57 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.38 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.36 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  26.25 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  28.4 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.27 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.77 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.77 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.77 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.77 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.77 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  28.05 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  28.63 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.34 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.1 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  27.45 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  25.88 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  25.88 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.88 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.69 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.69 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  25.88 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.88 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  27.52 
 
 		 257 aa  85.1  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.72 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  26.51 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  25.19 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.69 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  26.86 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.38 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>