More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0982 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  58.57 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  59.36 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  56.81 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  33.33 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 278 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  27.76 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  28.98 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  29.38 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.92 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.68 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.37 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.88 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  27.66 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  27.53 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.36 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  31.4 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  26.75 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  25.7 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.46 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  26.17 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.3 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  27.97 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  29.28 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  25.1 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28.35 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  25.59 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  26 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003595  transcriptional repressor of aga operon  27.8 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 309 aa  85.1  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  26.74 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  26.41 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  27.5 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2517  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0400027 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  27.31 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  28.19 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  25.1 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.48 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.48 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>