More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4649 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4742  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4799  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4649  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4659  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4778  transcriptional repressor UlaR  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04058  DNA-binding transcriptional dual regulator  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3822  transcriptional repressor UlaR  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3802  transcriptional regulator, DeoR family  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4750  transcriptional repressor UlaR  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4661  transcriptional repressor UlaR  96.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.815377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04020  hypothetical protein  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5706  transcriptional repressor UlaR  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4435  transcriptional repressor UlaR  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4720  transcriptional repressor UlaR  96.81 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0122  transcriptional repressor UlaR  69.35 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0286  transcriptional repressor UlaR  63.42 
 
 		 257 aa  353  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0982  transcriptional repressor UlaR  58.17 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  32.42 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2593  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518258  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0224  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0877662  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2185  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  26.42 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.17 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  29.02 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  28.92 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.02 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  27.66 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.06 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  28.23 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.56 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.19 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  26.77 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.15 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  26.59 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.57 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  27.2 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.45 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  27.57 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  27.92 
 
 		 263 aa  88.6  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  28.02 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  24.8 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  28.68 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  27.92 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  26.56 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  27.34 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>