More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8240 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  55.42 
 
 
287 aa  279  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  50.57 
 
 
262 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  54.47 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  45.81 
 
 
261 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  44.66 
 
 
277 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  43.43 
 
 
259 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  41.37 
 
 
280 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1511  transcriptional regulator, DeoR family  43.17 
 
 
280 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
273 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
294 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
254 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
262 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
254 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  39.32 
 
 
258 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 
290 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 
289 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 
258 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 
260 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
257 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.53 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32 
 
 
252 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 
266 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.37 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
255 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
255 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.26 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  32.26 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.91 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.3 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.69 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.4 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
242 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  35.19 
 
 
249 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.47 
 
 
263 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.59 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
269 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
262 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.36 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.45 
 
 
263 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
269 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
259 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
258 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.88 
 
 
269 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.96 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
253 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
255 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  36.56 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  33.19 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>