More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0851 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  54.35 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  38.63 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  35.4 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  33.93 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  33.93 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  35.75 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.73 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.35 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  34.43 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  32.59 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.95 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  35.59 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  34.84 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  32.74 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  27.23 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  34.23 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.87 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.19 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.87 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.52 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 		 264 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 253 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.31 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  29.46 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  32.74 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  31.48 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.68 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  27.06 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.49 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.89 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.44 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.65 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.7 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.7 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.7 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.7 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.7 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.22 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>