More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0971 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
260 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.25 
 
 
260 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  31.28 
 
 
253 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
252 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
252 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.48 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.91 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.91 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
254 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
257 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 
262 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  30.13 
 
 
270 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
259 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.67 
 
 
255 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.22 
 
 
252 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
254 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  29.54 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
257 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
257 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  32.39 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 
266 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.51 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  27 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.38 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.69 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  29.05 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  29.34 
 
 
251 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  29.22 
 
 
257 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4008  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.38 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.4 
 
 
254 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
251 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.96 
 
 
252 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.79 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  31.47 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  31.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  27.17 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  29.71 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 
257 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 
257 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.17 
 
 
251 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  28.99 
 
 
263 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.96 
 
 
252 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 
257 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 
257 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.17 
 
 
251 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  28.99 
 
 
263 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.96 
 
 
252 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
251 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
277 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>