More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0381 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  41.85 
 
 		 247 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  42.17 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  40.97 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  40.09 
 
 		 250 aa  161  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  44.23 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  39.65 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 250 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  40.83 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  40.64 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  38.33 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  38.53 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.64 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  39.51 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  36.74 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  36.92 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  36.48 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  38.6 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  37.44 
 
 		 257 aa  114  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.11 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  35.75 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  30.63 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.18 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  33.01 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  31.86 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  33.18 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.09 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  32.21 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.3 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  29.61 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  29.61 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  29.52 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.49 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  29.61 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.46 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.04 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.04 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>