More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2145 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  73.41 
 
 		 252 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  72.62 
 
 		 253 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  72 
 
 		 254 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  63.1 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  62.3 
 
 		 265 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  62.3 
 
 		 265 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  62.3 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  61.51 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  61.51 
 
 		 254 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  51.59 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  50.8 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  50.69 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  44.8 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  40.32 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  40.47 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3732  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  38.37 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  37.96 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.98 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.97 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  33.94 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.8 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.92 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.06 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.09 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.95 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.56 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.95 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.95 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.95 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.56 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.56 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  33.85 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>