More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4973 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
273 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4983  transcriptional regulator, DeoR family  68.18 
 
 
289 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947934  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  49.42 
 
 
277 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.92 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  35.34 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
258 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 
254 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  32.28 
 
 
261 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
256 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
254 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 
250 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.32 
 
 
258 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
261 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  34.26 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
261 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 
269 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
261 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
242 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
264 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.8 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
255 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
255 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  30.98 
 
 
255 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 
258 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
255 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  30.98 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.05 
 
 
257 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  32.03 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.5 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
254 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 
257 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 
257 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 
257 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 
257 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  31.37 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  31.37 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  31.37 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  31.37 
 
 
259 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 
263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  31.37 
 
 
259 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
283 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.3 
 
 
253 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 
252 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
252 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  31.67 
 
 
249 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 
262 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 
253 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.2 
 
 
258 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.17 
 
 
259 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  35.62 
 
 
267 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.47 
 
 
257 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.26 
 
 
252 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  30.49 
 
 
263 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.26 
 
 
252 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
257 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.41 
 
 
269 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
258 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  28.03 
 
 
252 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.26 
 
 
252 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 
287 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.06 
 
 
254 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>