More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  100 
 
 		 284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  41.38 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  39.77 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  38.85 
 
 		 261 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  41.18 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  38.61 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  37.89 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  38.24 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.17 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.23 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  37.94 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  25.2 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  26.27 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  32.69 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  27.73 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.27 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  29.12 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  24.79 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  30.19 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 257 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  29.53 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 254 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  24.9 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  25.69 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  24.31 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  28.23 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  24.62 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  25.78 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.63 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 		 253 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  28.82 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  27.92 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  24.22 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  35.95 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  26.15 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  25.6 
 
 		 257 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  29.65 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  34.36 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  25.4 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>