More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2688 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2267  transcriptional regulator, DeoR family  35.41 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.481568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  34.92 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.4 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.19 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  25.48 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.32 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  25.48 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.1 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  25.1 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.87 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.68 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.43 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.37 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.87 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.37 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  27.65 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.92 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.12 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  25.59 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  30.92 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  27.13 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  30.92 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  25.68 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  30.92 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  30.92 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  25.68 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  29.12 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  30.53 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.09 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  28.51 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 348 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  27.95 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  27.95 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>