69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4550 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  100 
 
 
952 aa  1927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2262  hypothetical protein  33.05 
 
 
706 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0655  hypothetical protein  28.49 
 
 
749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2492  hypothetical protein  28.99 
 
 
716 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000290492  normal  0.114754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3007  hypothetical protein  33.41 
 
 
694 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.85096  hitchhiker  0.000266003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2698  hypothetical protein  28.62 
 
 
694 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.36481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  95.16 
 
 
1083 aa  122  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  60.95 
 
 
387 aa  118  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  91.67 
 
 
814 aa  114  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  71.26 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  98.21 
 
 
766 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  88.71 
 
 
281 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  96.43 
 
 
721 aa  112  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  98.18 
 
 
108 aa  109  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  96.36 
 
 
383 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  98.15 
 
 
439 aa  108  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  96.36 
 
 
311 aa  107  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  69.77 
 
 
940 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  94.74 
 
 
100 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  91.38 
 
 
100 aa  107  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  94.64 
 
 
101 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  92.98 
 
 
160 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.3 
 
 
312 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  92.98 
 
 
202 aa  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  92.98 
 
 
167 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  94.55 
 
 
108 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  89.66 
 
 
93 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  96.3 
 
 
220 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  90 
 
 
137 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  60.2 
 
 
270 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  89.83 
 
 
634 aa  105  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  96.3 
 
 
94 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  94.55 
 
 
2200 aa  104  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  85.71 
 
 
260 aa  104  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  94.44 
 
 
80 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  94.55 
 
 
178 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  94.44 
 
 
114 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  91.07 
 
 
382 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  77.03 
 
 
172 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  79.41 
 
 
75 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  92.73 
 
 
166 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  90.32 
 
 
383 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  90.91 
 
 
109 aa  102  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  85.25 
 
 
382 aa  102  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  92.59 
 
 
95 aa  102  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  91.23 
 
 
87 aa  101  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  87.72 
 
 
373 aa  99  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  90.74 
 
 
297 aa  98.6  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  90.74 
 
 
183 aa  98.2  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  86.44 
 
 
107 aa  98.2  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  88.89 
 
 
358 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  90.57 
 
 
82 aa  96.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  84.48 
 
 
106 aa  95.1  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  83.93 
 
 
93 aa  93.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  81.03 
 
 
113 aa  92.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  83.64 
 
 
120 aa  87.8  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.18 
 
 
833 aa  81.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  64 
 
 
368 aa  62  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  87.1 
 
 
171 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  87.1 
 
 
171 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  87.1 
 
 
119 aa  55.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3087  hypothetical protein  80 
 
 
123 aa  51.2  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.678329  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  92 
 
 
125 aa  49.3  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4140  hypothetical protein  78.57 
 
 
173 aa  48.5  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3217  hypothetical protein  76.67 
 
 
79 aa  48.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  87.5 
 
 
226 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2403  hypothetical protein  95.83 
 
 
121 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1973  hypothetical protein  87.5 
 
 
85 aa  45.8  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  52.54 
 
 
304 aa  45.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>