More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0196 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  91.68 
 
 		 1167 aa  2153    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  81.28 
 
 		 1170 aa  1929    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  49.49 
 
 		 1170 aa  1060    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.04 
 
 		 1212 aa  1139    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  45.94 
 
 		 1137 aa  895    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  52 
 
 		 1170 aa  1132    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1167 aa  2362    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  53.48 
 
 		 1172 aa  1201    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  47.38 
 
 		 760 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  52.01 
 
 		 1194 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  51.92 
 
 		 829 aa  755    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  49.14 
 
 		 774 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  56.8 
 
 		 1160 aa  1287    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  92.35 
 
 		 1167 aa  2159    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  51.01 
 
 		 1160 aa  1104    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  50.42 
 
 		 1169 aa  1092    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  53.32 
 
 		 1168 aa  1191    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  48.9 
 
 		 906 aa  784    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  51.7 
 
 		 1170 aa  1163    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  49.11 
 
 		 1172 aa  1134    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  50.3 
 
 		 1169 aa  1083    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  45.05 
 
 		 1131 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  45.47 
 
 		 1136 aa  898    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  40.78 
 
 		 964 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  48.95 
 
 		 814 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  59.01 
 
 		 440 aa  522  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.36 
 
 		 1129 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.18 
 
 		 1116 aa  475  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 1145 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.97 
 
 		 1138 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1144 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.12 
 
 		 1147 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.98 
 
 		 835 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  37.85 
 
 		 1062 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  66.67 
 
 		 283 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  38.42 
 
 		 565 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.33 
 
 		 988 aa  316  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.71 
 
 		 971 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.23 
 
 		 969 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  50.19 
 
 		 312 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.43 
 
 		 941 aa  254  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.43 
 
 		 941 aa  254  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  33.1 
 
 		 1069 aa  254  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 1069 aa  254  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  31.15 
 
 		 805 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  31.36 
 
 		 801 aa  246  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.63 
 
 		 969 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.33 
 
 		 925 aa  241  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 933 aa  241  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.91 
 
 		 966 aa  241  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.14 
 
 		 922 aa  240  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  34.29 
 
 		 972 aa  240  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  34.34 
 
 		 962 aa  237  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.7 
 
 		 919 aa  229  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 877 aa  228  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.75 
 
 		 952 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 937 aa  220  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.97 
 
 		 1031 aa  212  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.1 
 
 		 1045 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.21 
 
 		 894 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 		 1058 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 1046 aa  202  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.87 
 
 		 572 aa  196  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.6 
 
 		 1057 aa  195  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.02 
 
 		 1082 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.02 
 
 		 1049 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1177 aa  191  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  31.44 
 
 		 1095 aa  190  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.89 
 
 		 1028 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  34.74 
 
 		 927 aa  181  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  26.63 
 
 		 1165 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.43 
 
 		 1044 aa  179  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.33 
 
 		 900 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  27.4 
 
 		 1201 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 		 1201 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.97 
 
 		 961 aa  173  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.18 
 
 		 584 aa  170  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.26 
 
 		 1038 aa  169  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  31.24 
 
 		 940 aa  167  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  27.44 
 
 		 560 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  28.52 
 
 		 975 aa  166  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.1 
 
 		 964 aa  164  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 955 aa  163  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.05 
 
 		 584 aa  160  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.34 
 
 		 933 aa  160  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.3 
 
 		 963 aa  160  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 		 1013 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  27.95 
 
 		 953 aa  157  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 921 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.37 
 
 		 961 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.37 
 
 		 915 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  26.25 
 
 		 951 aa  156  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.74 
 
 		 960 aa  155  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.52 
 
 		 937 aa  154  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 942 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.74 
 
 		 949 aa  154  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  35.06 
 
 		 346 aa  154  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  27.07 
 
 		 669 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.28 
 
 		 915 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>