More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1805 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1013 aa  2051    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.83 
 
 
988 aa  205  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 
1129 aa  198  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
937 aa  191  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1116 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.21 
 
 
1144 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.21 
 
 
835 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 
1172 aa  181  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  26.99 
 
 
941 aa  179  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.41 
 
 
969 aa  179  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  26.99 
 
 
941 aa  179  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.39 
 
 
919 aa  177  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1147 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.77 
 
 
1160 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
877 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1145 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 
819 aa  174  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.73 
 
 
971 aa  174  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
1170 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.19 
 
 
962 aa  171  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
964 aa  171  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  29.18 
 
 
813 aa  171  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.39 
 
 
1138 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.09 
 
 
933 aa  170  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.87 
 
 
952 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.73 
 
 
1169 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 
1169 aa  168  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  26.54 
 
 
801 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  26.78 
 
 
1062 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 
1170 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.73 
 
 
584 aa  164  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.85 
 
 
966 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1167 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  25.13 
 
 
922 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.31 
 
 
1170 aa  163  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.21 
 
 
584 aa  163  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  26.47 
 
 
1160 aa  162  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.52 
 
 
805 aa  162  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.16 
 
 
969 aa  161  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.08 
 
 
1167 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  27.82 
 
 
957 aa  160  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 
1167 aa  160  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.24 
 
 
578 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.5 
 
 
1212 aa  159  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.17 
 
 
900 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.21 
 
 
972 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.96 
 
 
950 aa  158  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  24.41 
 
 
927 aa  158  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.35 
 
 
555 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.29 
 
 
1049 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  26.83 
 
 
1194 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.06 
 
 
925 aa  156  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.1 
 
 
1172 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.26 
 
 
1069 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
1069 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.62 
 
 
554 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.61 
 
 
933 aa  155  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.23 
 
 
945 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  25.53 
 
 
969 aa  154  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  26.45 
 
 
1170 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 
1046 aa  154  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
968 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  25.41 
 
 
1136 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.84 
 
 
1028 aa  151  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  26.3 
 
 
923 aa  151  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.39 
 
 
560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.38 
 
 
1057 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.46 
 
 
560 aa  148  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 
1031 aa  148  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.1 
 
 
560 aa  147  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.92 
 
 
560 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 
1137 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
940 aa  147  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.72 
 
 
949 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  25.92 
 
 
560 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  26.68 
 
 
1082 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  26.94 
 
 
1044 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.8 
 
 
958 aa  146  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  25.69 
 
 
1165 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.15 
 
 
954 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  26.44 
 
 
953 aa  144  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.09 
 
 
960 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.07 
 
 
894 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  24.91 
 
 
829 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  25.64 
 
 
1095 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.36 
 
 
1045 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26 
 
 
958 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  25.38 
 
 
1201 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 
956 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  25.38 
 
 
1201 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
1058 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  27.79 
 
 
467 aa  137  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  25.59 
 
 
937 aa  137  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.06 
 
 
973 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>