More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1596 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.64 
 
 
1212 aa  862    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  46.54 
 
 
1168 aa  937    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  46.54 
 
 
1167 aa  909    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  46.01 
 
 
1167 aa  904    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  44.2 
 
 
1170 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  45.73 
 
 
1167 aa  892    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  48.03 
 
 
1172 aa  1014    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  47.14 
 
 
1194 aa  946    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  80.88 
 
 
829 aa  1254    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  44.98 
 
 
1169 aa  872    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  47.3 
 
 
1170 aa  924    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  60.72 
 
 
1131 aa  1253    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  77.04 
 
 
1136 aa  1782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  45.68 
 
 
1160 aa  885    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  45.93 
 
 
1170 aa  918    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  43.31 
 
 
1172 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  45.07 
 
 
1169 aa  871    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  43.71 
 
 
1160 aa  867    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  45.34 
 
 
1170 aa  887    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1137 aa  2316    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  42.87 
 
 
964 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  39.73 
 
 
906 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  49.65 
 
 
565 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  46.78 
 
 
814 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  35.07 
 
 
1129 aa  466  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  57.46 
 
 
440 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.58 
 
 
1116 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.97 
 
 
1138 aa  456  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  39.47 
 
 
774 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
1145 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  38.05 
 
 
760 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.43 
 
 
1144 aa  422  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.85 
 
 
835 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.32 
 
 
1147 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  39.61 
 
 
1062 aa  347  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  62.6 
 
 
283 aa  326  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.06 
 
 
988 aa  312  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  56.03 
 
 
312 aa  285  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.52 
 
 
969 aa  276  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.22 
 
 
971 aa  269  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.6 
 
 
941 aa  266  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.6 
 
 
941 aa  266  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
933 aa  265  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.28 
 
 
966 aa  254  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.97 
 
 
969 aa  250  9e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  31.62 
 
 
801 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.14 
 
 
1069 aa  241  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 
1069 aa  241  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
877 aa  240  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  31.99 
 
 
805 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.63 
 
 
972 aa  239  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 
962 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.98 
 
 
925 aa  234  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
937 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.91 
 
 
927 aa  231  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.07 
 
 
922 aa  231  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.62 
 
 
894 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.91 
 
 
952 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
1031 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.27 
 
 
919 aa  208  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.19 
 
 
1045 aa  207  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.25 
 
 
1046 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.87 
 
 
1095 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.74 
 
 
1049 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.81 
 
 
1057 aa  187  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.45 
 
 
900 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.99 
 
 
560 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28.46 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  28.29 
 
 
560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
1058 aa  186  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 
578 aa  185  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.97 
 
 
560 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
560 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28.62 
 
 
560 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  30.52 
 
 
1044 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.29 
 
 
1201 aa  177  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 
1201 aa  177  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.68 
 
 
1038 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.45 
 
 
584 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.98 
 
 
1165 aa  173  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.42 
 
 
915 aa  171  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.07 
 
 
940 aa  171  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.57 
 
 
916 aa  171  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 
955 aa  171  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.57 
 
 
915 aa  171  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.01 
 
 
555 aa  170  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
1177 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.44 
 
 
1082 aa  169  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
945 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 
963 aa  168  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.26 
 
 
1028 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.37 
 
 
584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
968 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.14 
 
 
953 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.38 
 
 
932 aa  164  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>